More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3733 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  100 
 
 
397 aa  775    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  46.87 
 
 
418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  42.32 
 
 
411 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  39.17 
 
 
433 aa  270  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
421 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  40.59 
 
 
442 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 
453 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  39.23 
 
 
413 aa  262  8.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
424 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 
453 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  36.29 
 
 
412 aa  259  6e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  40.86 
 
 
424 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  40.44 
 
 
406 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  35.32 
 
 
401 aa  241  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  38.44 
 
 
475 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  37.59 
 
 
467 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
538 aa  219  6e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  36.69 
 
 
467 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  36.8 
 
 
424 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  37.12 
 
 
467 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  40.82 
 
 
553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  36.03 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
464 aa  212  9e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  35.41 
 
 
550 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
464 aa  203  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 
518 aa  203  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
425 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  36.97 
 
 
467 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  37.04 
 
 
507 aa  196  7e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 
471 aa  196  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  35.43 
 
 
548 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  36.74 
 
 
551 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 
575 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  37.47 
 
 
549 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 
575 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  35.41 
 
 
549 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  33.96 
 
 
421 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
549 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  35.2 
 
 
419 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 
546 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  36.12 
 
 
552 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  34.37 
 
 
412 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
552 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  35.54 
 
 
552 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 
421 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  33.66 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
421 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  35.29 
 
 
537 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
408 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  36.44 
 
 
547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  32.65 
 
 
418 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  36.51 
 
 
558 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  35.55 
 
 
448 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  30.33 
 
 
412 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 
545 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 
545 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  36.99 
 
 
556 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
545 aa  176  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 
553 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  34.73 
 
 
553 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 
415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  34.46 
 
 
553 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  31.44 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  31.44 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  34.65 
 
 
432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  36.51 
 
 
566 aa  173  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  34.82 
 
 
552 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  36.22 
 
 
545 aa  172  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  35.51 
 
 
553 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  33.33 
 
 
556 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  34.99 
 
 
553 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
407 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  33.85 
 
 
554 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
407 aa  170  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  30.42 
 
 
408 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  30.73 
 
 
402 aa  169  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  33.24 
 
 
402 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  29.9 
 
 
402 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  29.26 
 
 
404 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  30.33 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  30.33 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  30.33 
 
 
402 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  42.65 
 
 
453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  30.93 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  30.33 
 
 
402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 
421 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  32.96 
 
 
391 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
405 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  30.95 
 
 
410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  31.75 
 
 
455 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
434 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  31.43 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  29.75 
 
 
412 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
465 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  29.04 
 
 
436 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  29.97 
 
 
398 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>