More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0598 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  78.29 
 
 
410 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  80.49 
 
 
412 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  100 
 
 
412 aa  816    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  79.76 
 
 
410 aa  646    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  39.02 
 
 
404 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 
425 aa  315  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 
415 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  41.71 
 
 
421 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 
421 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  41.96 
 
 
421 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  40.63 
 
 
442 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  37.04 
 
 
455 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  35.55 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 
434 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 
416 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  30.33 
 
 
397 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  34.04 
 
 
418 aa  177  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.02 
 
 
418 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  33.58 
 
 
419 aa  171  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  28.81 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  30.26 
 
 
412 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  30.81 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  29.01 
 
 
402 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  28.4 
 
 
408 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
398 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
421 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  29.41 
 
 
400 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
398 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
398 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.62 
 
 
398 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  27.37 
 
 
398 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.75 
 
 
402 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.27 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.27 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.27 
 
 
402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  29.91 
 
 
402 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  29.91 
 
 
402 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.12 
 
 
402 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
400 aa  155  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  28.9 
 
 
402 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
402 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  28.9 
 
 
402 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
407 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  28.21 
 
 
400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.79 
 
 
402 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  28.64 
 
 
402 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.12 
 
 
402 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  29.05 
 
 
402 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.4 
 
 
402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  27.29 
 
 
437 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
407 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.79 
 
 
402 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  29.19 
 
 
442 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
421 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  27.54 
 
 
413 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.56 
 
 
436 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
433 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  33.09 
 
 
404 aa  144  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.22 
 
 
432 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
411 aa  143  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  28.26 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.25 
 
 
400 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
436 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.33 
 
 
402 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  26.7 
 
 
436 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
436 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  26.14 
 
 
412 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  26.25 
 
 
400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  26.6 
 
 
400 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  27.89 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  26.63 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  26.6 
 
 
400 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  25.47 
 
 
432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  26.25 
 
 
400 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  26.25 
 
 
400 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 
400 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
405 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 
400 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  26.25 
 
 
400 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
441 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  28.2 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  27.45 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  26.81 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  27.45 
 
 
414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0056  major facilitator transporter  27.72 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00977888  hitchhiker  0.000481777 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  27.15 
 
 
406 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  27.45 
 
 
414 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
430 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  27.64 
 
 
430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>