226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0322 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  84.78 
 
 		 553 aa  894    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  72.96 
 
 		 549 aa  745    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  88.04 
 
 		 553 aa  946    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  61.68 
 
 		 556 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  68.45 
 
 		 552 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  87.68 
 
 		 553 aa  942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  68.88 
 
 		 545 aa  693    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  100 
 
 		 554 aa  1099    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  65.95 
 
 		 548 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  66.42 
 
 		 537 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  68.11 
 
 		 552 aa  679    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  66 
 
 		 549 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  72.51 
 
 		 575 aa  759    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  67.53 
 
 		 552 aa  698    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  67.03 
 
 		 550 aa  709    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  85.02 
 
 		 552 aa  901    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  70.77 
 
 		 547 aa  737    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  64.14 
 
 		 556 aa  687    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  69.05 
 
 		 545 aa  703    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  68.48 
 
 		 545 aa  708    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  85.14 
 
 		 553 aa  897    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  65.88 
 
 		 549 aa  688    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  69.06 
 
 		 545 aa  696    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  62.99 
 
 		 551 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  84.78 
 
 		 553 aa  892    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  72.51 
 
 		 575 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  72.63 
 
 		 566 aa  748    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  69.82 
 
 		 558 aa  728    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  61.8 
 
 		 546 aa  626  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  61.24 
 
 		 553 aa  620  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  59.85 
 
 		 538 aa  612  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  58.52 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  59.24 
 
 		 467 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  58.63 
 
 		 467 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  59.8 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  57.92 
 
 		 467 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 471 aa  399  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  48.24 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 		 464 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  43.69 
 
 		 507 aa  369  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  46.72 
 
 		 455 aa  365  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 518 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 448 aa  333  5e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 412 aa  260  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  36.88 
 
 		 424 aa  256  9e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 418 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 421 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  36.73 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 424 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  34.49 
 
 		 411 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  36.24 
 
 		 406 aa  226  8e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  32.77 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 442 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  29.71 
 
 		 428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 453 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  31.57 
 
 		 938 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 418 aa  128  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 419 aa  123  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 407 aa  123  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  38.07 
 
 		 679 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 432 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 		 416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.55 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  30.14 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.65 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 421 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  27.62 
 
 		 430 aa  94.7  3e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 421 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 421 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  27.47 
 
 		 404 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 431 aa  94  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.78 
 
 		 436 aa  92  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 412 aa  90.9  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  27.84 
 
 		 404 aa  90.5  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 434 aa  90.1  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 398 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.4 
 
 		 412 aa  88.6  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25.05 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  23.48 
 
 		 398 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 411 aa  87.8  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 408 aa  87.4  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 465 aa  87.4  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  23.26 
 
 		 398 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  23.26 
 
 		 398 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  23.26 
 
 		 398 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 454 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 408 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  21.92 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>