261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0961 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  92.46 
 
 		 464 aa  802    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  100 
 
 		 463 aa  917    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  74.28 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  72.94 
 
 		 471 aa  618  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  63.02 
 
 		 507 aa  519  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  63.23 
 
 		 456 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  60.54 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  59.96 
 
 		 455 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  58.5 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  52.97 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  53.04 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  52.09 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  52.31 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  53.19 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  46.48 
 
 		 549 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  44.91 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 546 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 		 545 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  46.12 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  45.14 
 
 		 538 aa  388  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  45.92 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  48.24 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  47.83 
 
 		 554 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  46.89 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 548 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 545 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  44.76 
 
 		 547 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  45.25 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 549 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  45.55 
 
 		 552 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  43.45 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 		 549 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 552 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  45.55 
 
 		 553 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  45.75 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 553 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 570 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 566 aa  359  6e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 556 aa  355  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  44.14 
 
 		 558 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 556 aa  337  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 		 424 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 		 421 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 418 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 411 aa  254  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 397 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  37.18 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  36.71 
 
 		 424 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  34.8 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  37.79 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  35.68 
 
 		 401 aa  219  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  33.86 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 432 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.1 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 412 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  32.35 
 
 		 938 aa  127  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  40.13 
 
 		 679 aa  120  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  29.46 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 415 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.41 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.68 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.68 
 
 		 402 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27 
 
 		 421 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  23.47 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.32 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 411 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 408 aa  103  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 414 aa  103  8e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 402 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.12 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  23.21 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>