244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3578 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  61.69 
 
 		 553 aa  635    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  65.06 
 
 		 549 aa  653    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  68.17 
 
 		 552 aa  685    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  65.06 
 
 		 548 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  65.06 
 
 		 549 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  100 
 
 		 553 aa  1073    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  69.27 
 
 		 552 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  69.65 
 
 		 552 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  69.89 
 
 		 546 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  65.62 
 
 		 550 aa  690    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  64.31 
 
 		 551 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  62.2 
 
 		 553 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  62.45 
 
 		 556 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  62.07 
 
 		 558 aa  619  1e-176  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  60.07 
 
 		 554 aa  617  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  60.81 
 
 		 547 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  61.41 
 
 		 575 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  61.41 
 
 		 575 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  62.32 
 
 		 549 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  61.58 
 
 		 552 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  59.38 
 
 		 556 aa  598  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  59.34 
 
 		 545 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  59.74 
 
 		 537 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  60.07 
 
 		 566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  60.89 
 
 		 553 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  60.62 
 
 		 545 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  61.13 
 
 		 545 aa  578  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  60.92 
 
 		 553 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  60.95 
 
 		 545 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  60.71 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  56.32 
 
 		 538 aa  552  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  55.47 
 
 		 475 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  55.01 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  55.01 
 
 		 467 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  54 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  55.33 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 570 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  48.63 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  50.21 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  48.4 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  47.48 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  46.94 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  43.5 
 
 		 507 aa  352  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 433 aa  279  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  35.87 
 
 		 418 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 411 aa  257  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 424 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 421 aa  252  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  36.21 
 
 		 413 aa  246  9.999999999999999e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  36.63 
 
 		 424 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  33.47 
 
 		 412 aa  244  3e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 397 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  35.31 
 
 		 406 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  33.49 
 
 		 401 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 442 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 453 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 453 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  28.94 
 
 		 428 aa  151  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 419 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 432 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  30.3 
 
 		 938 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 425 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  40.2 
 
 		 679 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 416 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 421 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  28.72 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 421 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  25.76 
 
 		 402 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  28.47 
 
 		 430 aa  99  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 391 aa  97.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.57 
 
 		 402 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.57 
 
 		 402 aa  97.8  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 411 aa  97.1  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 442 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  26.34 
 
 		 404 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 		 408 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  23.26 
 
 		 455 aa  94  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.07 
 
 		 412 aa  94.4  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 454 aa  94  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.19 
 
 		 402 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  23.4 
 
 		 398 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  23.4 
 
 		 398 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  23.4 
 
 		 398 aa  93.6  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.18 
 
 		 402 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 402 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  27.3 
 
 		 436 aa  93.2  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  24.94 
 
 		 402 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>