More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0515 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  100 
 
 
418 aa  829    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  64.02 
 
 
419 aa  490  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  67.25 
 
 
432 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 
416 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  49.62 
 
 
391 aa  349  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  47.28 
 
 
421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 
408 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  47.17 
 
 
404 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  33.25 
 
 
418 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  34.73 
 
 
411 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  32.65 
 
 
397 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 
425 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  34.64 
 
 
442 aa  199  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  33.09 
 
 
412 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
421 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
415 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  32.84 
 
 
410 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
424 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
433 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
411 aa  186  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  31.83 
 
 
412 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  33.5 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  33.33 
 
 
410 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  31.99 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  32.25 
 
 
424 aa  183  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.1 
 
 
408 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
436 aa  182  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
436 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  32.3 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  29.08 
 
 
436 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  30.58 
 
 
412 aa  179  8e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  31.46 
 
 
455 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
407 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  31.83 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  30.19 
 
 
437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
453 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  31.74 
 
 
454 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  30.45 
 
 
402 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 
407 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  29.48 
 
 
402 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  30.96 
 
 
402 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  30.96 
 
 
402 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 
453 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  34.09 
 
 
412 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  30.45 
 
 
402 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  29.7 
 
 
402 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  30.96 
 
 
402 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  30.45 
 
 
402 aa  169  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
437 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  30.45 
 
 
402 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  30.05 
 
 
400 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
434 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  30.66 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  30.52 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  30.66 
 
 
400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  30.49 
 
 
430 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  30.66 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  29.15 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  30.41 
 
 
400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  30.41 
 
 
400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  30.2 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  30.41 
 
 
400 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  25.81 
 
 
400 aa  163  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
429 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  27.75 
 
 
437 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  29.93 
 
 
400 aa  160  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 
405 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  29.93 
 
 
400 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  28.61 
 
 
424 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
437 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  28.67 
 
 
475 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  27.99 
 
 
437 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  31.37 
 
 
406 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
405 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  28.47 
 
 
436 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
465 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  27.54 
 
 
467 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
467 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  31.33 
 
 
424 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  26.82 
 
 
467 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
402 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.5 
 
 
402 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
402 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  26.5 
 
 
402 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  26.5 
 
 
400 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  28.67 
 
 
467 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  28.07 
 
 
431 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.23 
 
 
402 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  26.23 
 
 
402 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  29.45 
 
 
438 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  26.23 
 
 
400 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
441 aa  149  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  27.16 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  27.96 
 
 
398 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>