262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2301 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
518 aa  1011    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  66.02 
 
 
456 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  64.18 
 
 
464 aa  531  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  62.33 
 
 
463 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  62.14 
 
 
471 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  64.24 
 
 
455 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  61.28 
 
 
464 aa  502  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  55.68 
 
 
507 aa  465  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  60.45 
 
 
448 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  53.97 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  52.29 
 
 
467 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  52.31 
 
 
467 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  51.21 
 
 
467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  46.32 
 
 
553 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  52.14 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  49.21 
 
 
546 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 
545 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 
545 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  44.7 
 
 
552 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 
575 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 
552 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 
575 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 
545 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  44.5 
 
 
549 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  42.73 
 
 
550 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  43.06 
 
 
554 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  44.35 
 
 
545 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  44.27 
 
 
552 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  42.01 
 
 
553 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  42.22 
 
 
553 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  44.6 
 
 
538 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  45.36 
 
 
548 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  44.78 
 
 
566 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  46.62 
 
 
552 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  45.78 
 
 
549 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  44.72 
 
 
547 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 
549 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  44.32 
 
 
556 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  40.97 
 
 
551 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  44.27 
 
 
553 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  45.44 
 
 
558 aa  360  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  46.01 
 
 
556 aa  360  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  45.76 
 
 
537 aa  359  8e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  44.98 
 
 
553 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 
553 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  40.97 
 
 
570 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 
433 aa  293  7e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 
421 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  39.14 
 
 
412 aa  263  6e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  37.44 
 
 
411 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  37.32 
 
 
418 aa  259  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  38.12 
 
 
424 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  39.84 
 
 
413 aa  254  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 
424 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  40.56 
 
 
424 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  38.6 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  37.4 
 
 
406 aa  224  3e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  34.62 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  34.74 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  33.64 
 
 
442 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.8 
 
 
453 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
453 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
425 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  34.58 
 
 
938 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 
407 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  30.1 
 
 
421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  28.64 
 
 
432 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  30.2 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 
421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  29.17 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.25 
 
 
402 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.35 
 
 
418 aa  123  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.2 
 
 
419 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.64 
 
 
402 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.64 
 
 
402 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.74 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
411 aa  118  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.51 
 
 
402 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  42.22 
 
 
679 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  28.87 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  26.39 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.17 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.05 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.34 
 
 
402 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.05 
 
 
402 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  28.49 
 
 
422 aa  113  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  25.54 
 
 
408 aa  113  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.28 
 
 
402 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  24.41 
 
 
402 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  24.41 
 
 
402 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.67 
 
 
402 aa  111  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.34 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.58 
 
 
436 aa  111  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>