256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4642 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  63.72 
 
 		 553 aa  656    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  66.97 
 
 		 549 aa  667    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  64.62 
 
 		 558 aa  669    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  67.74 
 
 		 566 aa  670    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  66.42 
 
 		 553 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  65.44 
 
 		 553 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  66.6 
 
 		 545 aa  653    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  65.88 
 
 		 554 aa  705    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  66.23 
 
 		 545 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  74.63 
 
 		 552 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  100 
 
 		 548 aa  1097    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  86.34 
 
 		 549 aa  914    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  73.87 
 
 		 552 aa  761    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  66.3 
 
 		 575 aa  674    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  87.43 
 
 		 549 aa  926    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  67.82 
 
 		 546 aa  708    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  74.81 
 
 		 552 aa  786    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  67.6 
 
 		 556 aa  678    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  71.2 
 
 		 550 aa  774    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  67.82 
 
 		 547 aa  691    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  64.39 
 
 		 556 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  66.6 
 
 		 545 aa  652    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  66.3 
 
 		 575 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  65.38 
 
 		 545 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  64.68 
 
 		 553 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  65.37 
 
 		 552 aa  663    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  65.24 
 
 		 553 aa  680    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  73.5 
 
 		 551 aa  814    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  63.9 
 
 		 553 aa  655    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  61.5 
 
 		 537 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  58.47 
 
 		 538 aa  598  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  55.09 
 
 		 475 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  53.17 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  54.13 
 
 		 467 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  52.98 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  53.05 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  42.17 
 
 		 570 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  45.79 
 
 		 464 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  45.66 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 		 464 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  42.73 
 
 		 507 aa  363  6e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 		 518 aa  352  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  35.21 
 
 		 418 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  36.42 
 
 		 433 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  38 
 
 		 412 aa  268  2.9999999999999995e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 424 aa  253  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  35.15 
 
 		 413 aa  252  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  37.19 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  34 
 
 		 411 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  37.5 
 
 		 406 aa  228  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  34.83 
 
 		 401 aa  212  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  29.73 
 
 		 428 aa  179  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 453 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 442 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 453 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 453 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  27.8 
 
 		 938 aa  131  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 419 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 418 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 425 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 407 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 391 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  36.88 
 
 		 679 aa  113  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.4 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 421 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 408 aa  106  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  27.68 
 
 		 438 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25.59 
 
 		 398 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25.59 
 
 		 398 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  31.11 
 
 		 404 aa  101  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25.59 
 
 		 398 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 402 aa  101  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  25.14 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  25.14 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  25.14 
 
 		 402 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  25.14 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 415 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.35 
 
 		 398 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.35 
 
 		 398 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.36 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  24.86 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  24.86 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  24.86 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  24.64 
 
 		 402 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  26.86 
 
 		 430 aa  97.4  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 407 aa  97.4  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  24.58 
 
 		 400 aa  97.4  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 416 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>