More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3728 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  100 
 
 
411 aa  810    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  44.1 
 
 
418 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  42.32 
 
 
397 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  41.58 
 
 
412 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  41.32 
 
 
424 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  40.85 
 
 
413 aa  292  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  37.41 
 
 
433 aa  279  7e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 
424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  39.22 
 
 
406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  37.56 
 
 
401 aa  259  8e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
538 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
467 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  37.21 
 
 
467 aa  255  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  38.13 
 
 
424 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  37.44 
 
 
467 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  38.35 
 
 
475 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
575 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 
575 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  35.32 
 
 
442 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 
546 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  34.28 
 
 
550 aa  239  5.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 
453 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  38.03 
 
 
467 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  36.58 
 
 
553 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  35.57 
 
 
549 aa  236  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
471 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 
453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
456 aa  233  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 
455 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  37.47 
 
 
463 aa  229  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  35.15 
 
 
547 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 
464 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 
518 aa  225  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 
464 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  34 
 
 
548 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 
448 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  34.37 
 
 
537 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  33.33 
 
 
549 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  34.13 
 
 
556 aa  216  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  33.93 
 
 
556 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
553 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  33.55 
 
 
558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
549 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  34.49 
 
 
554 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  33.19 
 
 
553 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  33.41 
 
 
553 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  33.26 
 
 
552 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  33.49 
 
 
545 aa  212  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  33.47 
 
 
553 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  34.93 
 
 
551 aa  210  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  33.47 
 
 
553 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
552 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  33.41 
 
 
566 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  36.07 
 
 
507 aa  206  5e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 
545 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
552 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  33.96 
 
 
552 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
545 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
545 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 
425 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  32.45 
 
 
421 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  35.44 
 
 
418 aa  189  7e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
421 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
421 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
415 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  32 
 
 
412 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
416 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 
407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  31.72 
 
 
431 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 
407 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  32.02 
 
 
442 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
408 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.22 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  31.19 
 
 
400 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  31.37 
 
 
400 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  28.81 
 
 
412 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  28.89 
 
 
402 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  29.58 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  29.58 
 
 
402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
465 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  29.35 
 
 
402 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  31.08 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  31.05 
 
 
428 aa  163  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  29.61 
 
 
400 aa  163  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  31.13 
 
 
400 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
405 aa  163  7e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  29.38 
 
 
402 aa  163  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  29.61 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  29.61 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  29.61 
 
 
400 aa  162  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  29.35 
 
 
402 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  32.35 
 
 
391 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  29.35 
 
 
402 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  29.35 
 
 
402 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  30.88 
 
 
400 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  29.35 
 
 
402 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  30.93 
 
 
402 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>