More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1890 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 424 aa  848    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  56.83 
 
 		 421 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  55.26 
 
 		 424 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  49.88 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  46 
 
 		 412 aa  365  1e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  48.04 
 
 		 413 aa  362  7.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  45.48 
 
 		 401 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  45.38 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 418 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 550 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 538 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 455 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 424 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 553 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 552 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  38.56 
 
 		 553 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  38.33 
 
 		 553 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  39.73 
 
 		 467 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  39.5 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 575 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 575 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 		 552 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 552 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  36.33 
 
 		 549 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  40.58 
 
 		 467 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 546 aa  255  8e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 554 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  39.08 
 
 		 475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  37.34 
 
 		 552 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 549 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 556 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 553 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  37.19 
 
 		 548 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  36.67 
 
 		 553 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 549 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 397 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 553 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 537 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 566 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  35.02 
 
 		 547 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 518 aa  238  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 471 aa  238  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  37.96 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  35.88 
 
 		 558 aa  236  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 545 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 		 545 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 556 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 545 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 442 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 545 aa  229  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  37.56 
 
 		 507 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  35.48 
 
 		 428 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  30.79 
 
 		 402 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  29.5 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  29.5 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  29.74 
 
 		 402 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  29.5 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  31.06 
 
 		 402 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  29.74 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 418 aa  159  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  30.79 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  30.79 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 416 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  29.62 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  30.59 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000134244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  29.43 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  29.43 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 434 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  29.16 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  29.16 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  29.16 
 
 		 400 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 400 aa  143  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  26.23 
 
 		 410 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>