249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0620 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  64.32 
 
 		 553 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  65.25 
 
 		 549 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  64.8 
 
 		 558 aa  659    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  67.45 
 
 		 546 aa  693    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  65.99 
 
 		 553 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  66.36 
 
 		 575 aa  670    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  66.54 
 
 		 553 aa  694    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  68.6 
 
 		 556 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  66 
 
 		 554 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  66.48 
 
 		 545 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  74.95 
 
 		 552 aa  760    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  87.61 
 
 		 548 aa  937    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  63.62 
 
 		 537 aa  641    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  100 
 
 		 549 aa  1095    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  90.89 
 
 		 549 aa  956    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  65.36 
 
 		 545 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  65.43 
 
 		 553 aa  681    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  69.93 
 
 		 550 aa  768    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  64.68 
 
 		 553 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  68.37 
 
 		 547 aa  688    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  64.32 
 
 		 556 aa  678    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  76.23 
 
 		 552 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  66.48 
 
 		 545 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  65.19 
 
 		 545 aa  661    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  67.86 
 
 		 566 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  65.74 
 
 		 552 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  77.05 
 
 		 552 aa  801    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  66.36 
 
 		 575 aa  670    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  76.77 
 
 		 551 aa  840    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  64.32 
 
 		 553 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  59.55 
 
 		 538 aa  605  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  57.06 
 
 		 475 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  54.93 
 
 		 467 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  54.53 
 
 		 467 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  54.73 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  54.47 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 570 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  46.26 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 456 aa  382  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  45.29 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  45.47 
 
 		 464 aa  362  7.0000000000000005e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  47.18 
 
 		 448 aa  354  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  43.67 
 
 		 507 aa  353  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 		 518 aa  352  7e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 433 aa  274  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  38.6 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  36.26 
 
 		 413 aa  253  6e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  36.33 
 
 		 424 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  39.18 
 
 		 424 aa  249  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  39.18 
 
 		 406 aa  246  6e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 424 aa  230  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 397 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  34.37 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  31.14 
 
 		 428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 442 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  31.24 
 
 		 453 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0820  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 453 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 419 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 432 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  28.28 
 
 		 938 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 391 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  27.72 
 
 		 412 aa  123  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 408 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  32.04 
 
 		 679 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.71 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  26.95 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26.71 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26.71 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26.71 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.48 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 421 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 421 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.6 
 
 		 436 aa  106  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  28.64 
 
 		 429 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  27.92 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.1 
 
 		 430 aa  104  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 411 aa  103  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 437 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.11 
 
 		 410 aa  100  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 437 aa  100  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  25.5 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.72 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.72 
 
 		 402 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 402 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  23.24 
 
 		 400 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>