More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1032 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  100 
 
 		 404 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  50 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  49.22 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 		 421 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 		 408 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  48.29 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  45.08 
 
 		 432 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  33.09 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 407 aa  160  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  29.97 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 415 aa  159  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.1 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  30.48 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 421 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 421 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  30.3 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  26.05 
 
 		 404 aa  150  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  28.88 
 
 		 455 aa  149  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  30.67 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.76 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.76 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 424 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.09 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.27 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  28.5 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  27.89 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.52 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.76 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  25.76 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.26 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.63 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  27.42 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 465 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.26 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  28.5 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  28.5 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  29.06 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  29.06 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  28.5 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  28.82 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  28.82 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  28.82 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  27.68 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 429 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  24.6 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  24.6 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  28.24 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  24.34 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  24.34 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  24.34 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  28 
 
 		 467 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 431 aa  121  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 433 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>