More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1906 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  95.83 
 
 
432 aa  801    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  89.69 
 
 
433 aa  761    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  83.09 
 
 
429 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  95.83 
 
 
432 aa  801    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  874    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  75.25 
 
 
431 aa  643    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  83.09 
 
 
429 aa  689    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  73.62 
 
 
450 aa  601  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  68.62 
 
 
438 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  53.15 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  53.24 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  56.83 
 
 
441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  55.34 
 
 
424 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  52.08 
 
 
437 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  55.18 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  52.1 
 
 
436 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  52.47 
 
 
436 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  54.24 
 
 
424 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  52.47 
 
 
436 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  53.57 
 
 
432 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  54.11 
 
 
436 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  53.2 
 
 
429 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  53.11 
 
 
430 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  52.52 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  53.37 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 
437 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  50.58 
 
 
436 aa  412  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  53.07 
 
 
419 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  51.2 
 
 
439 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  51.85 
 
 
441 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  50 
 
 
438 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  47.2 
 
 
447 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  48.43 
 
 
428 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  53.32 
 
 
446 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  49.5 
 
 
441 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  49.39 
 
 
441 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  49.39 
 
 
441 aa  360  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  46.9 
 
 
443 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  45.63 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 
447 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  45.35 
 
 
447 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  47.22 
 
 
417 aa  346  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  45.86 
 
 
439 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  50.49 
 
 
428 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  46.44 
 
 
446 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  46.34 
 
 
443 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  50.47 
 
 
428 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
429 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  41.33 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 
430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  41.26 
 
 
422 aa  319  6e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  37.24 
 
 
438 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  38.15 
 
 
421 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  35.68 
 
 
431 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  31.48 
 
 
411 aa  160  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.47 
 
 
430 aa  159  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.6 
 
 
418 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
416 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
425 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  26.25 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.29 
 
 
412 aa  133  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
407 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  26.59 
 
 
400 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.04 
 
 
402 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  28.46 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  25.63 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  25.19 
 
 
402 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  26.1 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.81 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  26.1 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  25.61 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  24.94 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  26.1 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  26.1 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  26.1 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  25.61 
 
 
400 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.08 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  28.68 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  27.76 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.46 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  26.98 
 
 
402 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  24.94 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.94 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.94 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
408 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  30.11 
 
 
391 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.06 
 
 
436 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.55 
 
 
402 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
405 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  25.67 
 
 
400 aa  123  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  25.3 
 
 
402 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.3 
 
 
402 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  25.3 
 
 
402 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.01 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>