More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1247 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  74.81 
 
 
432 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  100 
 
 
431 aa  862    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  74.81 
 
 
432 aa  635    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  75.56 
 
 
432 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  75.31 
 
 
433 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  75.18 
 
 
429 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  75.18 
 
 
429 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  69.69 
 
 
450 aa  576  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  67.68 
 
 
438 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  56.4 
 
 
425 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  56.19 
 
 
441 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  56.42 
 
 
424 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  55.66 
 
 
424 aa  456  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  55.34 
 
 
436 aa  448  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  53.73 
 
 
436 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  53.73 
 
 
436 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  56.3 
 
 
441 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  53.73 
 
 
436 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  55.37 
 
 
436 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  55.96 
 
 
432 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  53.12 
 
 
437 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  52.88 
 
 
437 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  51.07 
 
 
437 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  52.81 
 
 
429 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  51.55 
 
 
437 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  54.39 
 
 
439 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 
437 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  53.71 
 
 
419 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  53.22 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  53.24 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  52.9 
 
 
441 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  51.57 
 
 
428 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  48.63 
 
 
447 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  50.97 
 
 
441 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  54.63 
 
 
446 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  50.36 
 
 
441 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 
441 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  48.45 
 
 
447 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  47.85 
 
 
447 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  46.88 
 
 
443 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  49.16 
 
 
443 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  46.57 
 
 
444 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  47.51 
 
 
439 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  47.12 
 
 
417 aa  361  1e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  46.48 
 
 
446 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  52.1 
 
 
428 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  48.43 
 
 
443 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  51.56 
 
 
428 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  44.75 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  44.5 
 
 
430 aa  335  9e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 
430 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  41.35 
 
 
422 aa  334  2e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  40.2 
 
 
421 aa  276  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  36.6 
 
 
431 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  38.07 
 
 
438 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  31.72 
 
 
411 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  31.09 
 
 
418 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.21 
 
 
430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
416 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
436 aa  143  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  29.2 
 
 
401 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
405 aa  140  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.02 
 
 
400 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.86 
 
 
408 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.4 
 
 
412 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.27 
 
 
397 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
407 aa  136  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
407 aa  136  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  29.04 
 
 
402 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 
425 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.77 
 
 
402 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.49 
 
 
402 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 
421 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  29.44 
 
 
412 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  29.04 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.95 
 
 
421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  28.08 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  29.13 
 
 
442 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.07 
 
 
418 aa  131  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 
416 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.77 
 
 
402 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.77 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  30.06 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  29.12 
 
 
400 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  29.32 
 
 
400 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  29.32 
 
 
400 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  29.32 
 
 
442 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  29.32 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  29.32 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  29.32 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.49 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.49 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.49 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.77 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.64 
 
 
419 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  26.09 
 
 
400 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
421 aa  126  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>