More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1211 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  100 
 
 		 441 aa  885    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  96.15 
 
 		 441 aa  793    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  82.13 
 
 		 428 aa  662    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  99.77 
 
 		 441 aa  883    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  83.29 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  81.41 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  70.86 
 
 		 438 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  57.44 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  59.86 
 
 		 437 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  63.52 
 
 		 425 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  59.08 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  59.08 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  59.62 
 
 		 437 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  62.38 
 
 		 441 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  60.57 
 
 		 424 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  60.53 
 
 		 441 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  60.44 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  58.47 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  59.18 
 
 		 436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  59.18 
 
 		 432 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  60.19 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  59.91 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  54.97 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  55.53 
 
 		 437 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  55.45 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  54.43 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  56.61 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  56.76 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  56.02 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  55.29 
 
 		 443 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  60.92 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  55.71 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  54.57 
 
 		 446 aa  428  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  55.94 
 
 		 439 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  54.12 
 
 		 447 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  55.16 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  55.24 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  49.26 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  51.2 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  49.26 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  49.39 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  49.03 
 
 		 433 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  52.74 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 450 aa  359  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  45.66 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 430 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 422 aa  285  8e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 421 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  35.73 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 431 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.75 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 411 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 391 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.49 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.57 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  28.57 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.28 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  29.78 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 402 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.28 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.99 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.99 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.28 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.29 
 
 		 436 aa  126  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.28 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.99 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  25.74 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  25.74 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  25.5 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  25.5 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  25.5 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  25.5 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  25.5 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.18 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  25.74 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.18 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>