232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0852 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  100 
 
 		 380 aa  725    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  43.86 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2110  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 371 aa  243  5e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0505965  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.1 
 
 		 430 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  27.4 
 
 		 447 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 431 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 441 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 431 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 436 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 424 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 425 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 436 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  27.12 
 
 		 429 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 437 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  27.73 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  26.99 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  26.89 
 
 		 443 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 439 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 428 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  27.51 
 
 		 441 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 429 aa  102  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 441 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 441 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 458 aa  99.8  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  28.77 
 
 		 438 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 391 aa  90.1  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.09 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  25.47 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.44 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.78 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  25.69 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.69 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 398 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.08 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  23.99 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.08 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.38 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0056  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00977888  hitchhiker  0.000481777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  23.6 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0058  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000719685  decreased coverage  0.000000078318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>