272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1924 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
458 aa  882    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  56.03 
 
 
416 aa  375  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  35.14 
 
 
430 aa  223  7e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 
436 aa  203  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
436 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  31.43 
 
 
436 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
436 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  28.85 
 
 
431 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  29.44 
 
 
437 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
429 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  30.58 
 
 
430 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
430 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
437 aa  144  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  31.63 
 
 
421 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  28.95 
 
 
422 aa  138  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  29.16 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  31 
 
 
432 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 
436 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.07 
 
 
402 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.07 
 
 
402 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  30.73 
 
 
425 aa  136  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.57 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  28.61 
 
 
379 aa  136  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.57 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.39 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.57 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.32 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.39 
 
 
402 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  30.27 
 
 
424 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  30.02 
 
 
446 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  29.13 
 
 
444 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
441 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  28.16 
 
 
447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  27.67 
 
 
429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.64 
 
 
402 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
419 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  29.37 
 
 
443 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 
432 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  27.57 
 
 
437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
437 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
432 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  26.7 
 
 
437 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  29.38 
 
 
432 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
430 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  28.57 
 
 
417 aa  124  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.04 
 
 
400 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  28.57 
 
 
439 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  29.3 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  27.91 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  26.13 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.43 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.86 
 
 
408 aa  121  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  28.24 
 
 
447 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
425 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  28.39 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  28.33 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  28.32 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  28.32 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  28.32 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  26.61 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.88 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  29.13 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  28.32 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  28.32 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 
455 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  28.6 
 
 
428 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.42 
 
 
412 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  28.11 
 
 
438 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  28.81 
 
 
439 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  27.45 
 
 
443 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  28.67 
 
 
441 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
441 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  27.7 
 
 
382 aa  106  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
416 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  27.61 
 
 
438 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
407 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  28.16 
 
 
441 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  29.23 
 
 
428 aa  103  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  27.53 
 
 
404 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
421 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
443 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2110  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
371 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0505965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
405 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
407 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  26.69 
 
 
418 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
450 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  28.39 
 
 
446 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  28.97 
 
 
467 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
467 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.54 
 
 
380 aa  97.8  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  29.16 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  29.16 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
434 aa  93.6  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.1 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  26.94 
 
 
424 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>