More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5265 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  855    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  84.71 
 
 		 433 aa  706    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  75.18 
 
 		 431 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  82.01 
 
 		 432 aa  693    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  855    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  82.01 
 
 		 432 aa  693    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  82.41 
 
 		 432 aa  692    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  73.32 
 
 		 450 aa  592  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  70.05 
 
 		 438 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  56.32 
 
 		 424 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  55.86 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  55.26 
 
 		 437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  54.07 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  54.65 
 
 		 429 aa  448  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  57.61 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  55.56 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  56.8 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  56.61 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  52.12 
 
 		 436 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  56.37 
 
 		 419 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  54.61 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  51.52 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  51.52 
 
 		 436 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  54.55 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  54.9 
 
 		 436 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  53.27 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  52.76 
 
 		 436 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  53.03 
 
 		 437 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  51.98 
 
 		 439 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  52.05 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  46.21 
 
 		 447 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  52.46 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  50.36 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  51.58 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  45.79 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  46.38 
 
 		 447 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  45.52 
 
 		 447 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  48.08 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  46.15 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  52.46 
 
 		 428 aa  348  7e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 428 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 446 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  46.51 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 430 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  43.51 
 
 		 430 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  46.88 
 
 		 417 aa  332  6e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 422 aa  322  8e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 421 aa  266  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  36.28 
 
 		 438 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  31.05 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.68 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  30.06 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.73 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.18 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.49 
 
 		 402 aa  134  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.82 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.43 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.43 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.49 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.29 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  26.29 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  26.04 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.04 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  26.04 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 421 aa  130  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 418 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  26.89 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 425 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  25.62 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>