More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3406 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  803    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  74.3 
 
 
407 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  72.68 
 
 
407 aa  565  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  65.58 
 
 
405 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  65.66 
 
 
405 aa  521  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  61.54 
 
 
402 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  61.54 
 
 
402 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  61.33 
 
 
402 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  61.33 
 
 
402 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  61.33 
 
 
402 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  62.22 
 
 
402 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  62.47 
 
 
402 aa  484  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  61.04 
 
 
402 aa  482  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  61.29 
 
 
402 aa  481  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  61.54 
 
 
402 aa  482  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  61.5 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  61.75 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  61.75 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  61.73 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  61.75 
 
 
400 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  61.19 
 
 
400 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  61.5 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  61.5 
 
 
400 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  60.95 
 
 
400 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  60.96 
 
 
402 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  61.06 
 
 
358 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000134244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  45.77 
 
 
400 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  44.11 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  44.11 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  44.11 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  44.39 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  44.11 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  44.11 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  44.11 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  44.11 
 
 
400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  43.86 
 
 
400 aa  336  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  49.19 
 
 
414 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0058  major facilitator transporter  49.19 
 
 
414 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000719685  decreased coverage  0.000000078318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  49.19 
 
 
414 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0056  major facilitator transporter  49.19 
 
 
414 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00977888  hitchhiker  0.000481777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 
414 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  48.92 
 
 
414 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0886  major facilitator superfamily permease  36.1 
 
 
461 aa  219  6e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0290248  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  30.58 
 
 
418 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  30.73 
 
 
410 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  30.4 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  30.4 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  30.4 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  30.15 
 
 
398 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  30.42 
 
 
397 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  30.91 
 
 
398 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.67 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.22 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  29.87 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  30.85 
 
 
401 aa  164  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  28.4 
 
 
412 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  29.72 
 
 
412 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
433 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
407 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
421 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
414 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  29.33 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  29.4 
 
 
404 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  31.96 
 
 
442 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  27.48 
 
 
412 aa  152  8e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
425 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.14 
 
 
432 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 
424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  29.43 
 
 
424 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.46 
 
 
412 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  29.52 
 
 
455 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.63 
 
 
419 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  29.73 
 
 
424 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  28.07 
 
 
406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  30.42 
 
 
447 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
408 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  29.86 
 
 
431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  27.62 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
441 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  27.5 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.58 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  26.8 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  28.95 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
421 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  28.11 
 
 
429 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.42 
 
 
421 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  28.11 
 
 
429 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 
436 aa  133  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
421 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  26.63 
 
 
454 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
432 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  27.3 
 
 
432 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  26.86 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>