More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4366 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  87.68 
 
 		 443 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  81.47 
 
 		 444 aa  705    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 447 aa  897    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  77.83 
 
 		 439 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  74.77 
 
 		 447 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  78.1 
 
 		 447 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  71.82 
 
 		 446 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  70.97 
 
 		 443 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  69.43 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  70.72 
 
 		 417 aa  523  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  57.66 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  57.66 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  58.23 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  58.44 
 
 		 436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  58.37 
 
 		 437 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  60.05 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  57.7 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  59.06 
 
 		 441 aa  461  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  58.37 
 
 		 437 aa  464  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  57.87 
 
 		 439 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  59.8 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  58.91 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  59.8 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  58.56 
 
 		 419 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  59.85 
 
 		 425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  56.73 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  57.65 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  55.17 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  54.91 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  54.46 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  54.09 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  54.03 
 
 		 430 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  52.62 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  59.02 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  54.73 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  54.73 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  48.63 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  55.47 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  53.68 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  48.13 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  48.13 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 		 432 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  45.69 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 		 450 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 430 aa  289  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 430 aa  289  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 422 aa  276  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 421 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 431 aa  236  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  35.58 
 
 		 438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  34.14 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.94 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.2 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  29.62 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  30.87 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27.68 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.94 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 411 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.94 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.68 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.68 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.74 
 
 		 402 aa  136  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  31.33 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 408 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 380 aa  133  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.81 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  26.73 
 
 		 400 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 436 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 415 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  27.95 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.79 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  26.49 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.34 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  26.56 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  26.56 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  26.56 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  26.56 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  26.56 
 
 		 400 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.7 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>