More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3800 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  81.28 
 
 		 439 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  82.71 
 
 		 441 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  100 
 
 		 446 aa  890    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  69.34 
 
 		 436 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  70.67 
 
 		 436 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  71.64 
 
 		 441 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  71.32 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  69.34 
 
 		 436 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  69.34 
 
 		 436 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  69.57 
 
 		 436 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  73.07 
 
 		 424 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  73.13 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  70.94 
 
 		 441 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  72.7 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  67.33 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  67.33 
 
 		 437 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  68.07 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  59.86 
 
 		 437 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  61.58 
 
 		 429 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  60.1 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  59.86 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  62.01 
 
 		 430 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  58.92 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  59.02 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  60.66 
 
 		 428 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  58.47 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  58.37 
 
 		 444 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  60.77 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  56.45 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  61.11 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  61.35 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  53.83 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  56.21 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  55.48 
 
 		 447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  62.09 
 
 		 428 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  62.74 
 
 		 428 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  55.85 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  54.93 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  57.24 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  53.41 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  52.05 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  54.15 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  53.51 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  51.36 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 		 429 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 430 aa  326  5e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 430 aa  326  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  44.06 
 
 		 422 aa  323  5e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  39.61 
 
 		 438 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 431 aa  239  9e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.29 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.23 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.23 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.98 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.66 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.49 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.98 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.49 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.97 
 
 		 402 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  29.53 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  29.53 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  29.53 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  29.53 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  29.53 
 
 		 400 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.73 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  29.03 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  29.78 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 		 407 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  29.53 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 405 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 411 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.86 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.01 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  30.9 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000134244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.61 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>