More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4656 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  885    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  90.99 
 
 		 444 aa  787    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  87.68 
 
 		 447 aa  749    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  76.5 
 
 		 439 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  78.13 
 
 		 447 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  77.15 
 
 		 447 aa  617  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  76.34 
 
 		 446 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  71.16 
 
 		 443 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  71.86 
 
 		 443 aa  566  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  71.71 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  57.97 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  56.16 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  58.27 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  56.16 
 
 		 436 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  57.77 
 
 		 436 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  58.35 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  59.95 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  57.83 
 
 		 441 aa  458  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  57.88 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  58.48 
 
 		 419 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  59.06 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  59.5 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  59.06 
 
 		 432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  57.88 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  57.62 
 
 		 425 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  56.97 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  58.6 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  58.47 
 
 		 446 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  56.09 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  52.96 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  53.75 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  56.72 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 437 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  53.96 
 
 		 429 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  52.38 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  55.97 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  55.97 
 
 		 441 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  56.79 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  56.45 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  47.13 
 
 		 433 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  46.77 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  45.79 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  45.79 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 		 450 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  45.87 
 
 		 438 aa  353  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 		 429 aa  285  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  38.3 
 
 		 422 aa  273  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  39.16 
 
 		 421 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  35.42 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  34.45 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  31.71 
 
 		 430 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.05 
 
 		 402 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.05 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  28.05 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.05 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.05 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.05 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.31 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.31 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0852  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.498161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  29.24 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  27.45 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  27.21 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.88 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  30 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 391 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.88 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.97 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  26.98 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  26.98 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  26.98 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  26.98 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  26.98 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.08 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.79 
 
 		 436 aa  126  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>