270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2503 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
436 aa  875    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 
416 aa  187  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
458 aa  186  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.75 
 
 
430 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  27.88 
 
 
431 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 
436 aa  142  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  29.46 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  29.08 
 
 
429 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
432 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
436 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  28.39 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  28.68 
 
 
437 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
437 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  26.77 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  29.27 
 
 
437 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
437 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  29.49 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  29.49 
 
 
429 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  28.34 
 
 
438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  26.08 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
441 aa  130  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
430 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
429 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  26.49 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26.37 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  27.3 
 
 
422 aa  126  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.4 
 
 
418 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
441 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.28 
 
 
412 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  27.68 
 
 
431 aa  123  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  25.33 
 
 
425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  25.94 
 
 
432 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  25.71 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  26.81 
 
 
444 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  28.57 
 
 
439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  24.93 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 
419 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  28.98 
 
 
421 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  27.02 
 
 
447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  26.08 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
421 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  28.57 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  27.65 
 
 
446 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  26.19 
 
 
438 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  27.1 
 
 
436 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0504  major facilitator transporter  25.07 
 
 
379 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.82034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  25.98 
 
 
400 aa  104  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.98 
 
 
402 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
425 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.08 
 
 
408 aa  103  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  25.49 
 
 
402 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  25.98 
 
 
400 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  25.98 
 
 
402 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  25.98 
 
 
402 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  27.18 
 
 
382 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  25.7 
 
 
402 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.7 
 
 
402 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  25.7 
 
 
402 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  25.77 
 
 
412 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  25.67 
 
 
439 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  25.95 
 
 
438 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  26.74 
 
 
417 aa  97.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  25.07 
 
 
404 aa  97.1  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
428 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
441 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.93 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  26.08 
 
 
441 aa  95.5  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  25.77 
 
 
442 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  25.2 
 
 
428 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  26.58 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
443 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  25.12 
 
 
442 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.26 
 
 
410 aa  93.6  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  24.93 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  24.02 
 
 
400 aa  92.8  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1204  major facilitator transporter  28.32 
 
 
510 aa  92.8  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 
421 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  24.35 
 
 
443 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
416 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 
408 aa  90.9  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  23.91 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  25.88 
 
 
446 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
407 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
407 aa  87  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
434 aa  86.3  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  25.74 
 
 
400 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>