More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0444 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  835    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  60.3 
 
 		 430 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  59.55 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  60.3 
 
 		 430 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  63.61 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 441 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  41.61 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 433 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  41.63 
 
 		 432 aa  310  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 432 aa  310  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 419 aa  310  5e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 437 aa  308  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  41.63 
 
 		 432 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 437 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 424 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 450 aa  306  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 441 aa  302  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  41.25 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 		 436 aa  299  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 436 aa  299  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  40.99 
 
 		 424 aa  295  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  41 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  39.37 
 
 		 429 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  38.89 
 
 		 437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 437 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  39.95 
 
 		 438 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  39.71 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 444 aa  269  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 447 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 441 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 441 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  38.78 
 
 		 447 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  38.21 
 
 		 443 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 446 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 417 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  38.2 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 428 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  39.08 
 
 		 443 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  39.04 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  31.83 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 412 aa  157  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  29.61 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  28.26 
 
 		 412 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.62 
 
 		 402 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.62 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.62 
 
 		 402 aa  135  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.42 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  27.55 
 
 		 412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.42 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.62 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 421 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.86 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  26.62 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  28.27 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.62 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 407 aa  133  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 442 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  29.89 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  29.46 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  29.47 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  28.37 
 
 		 400 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.98 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>