More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5586 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  82.8 
 
 
441 aa  643    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  82.8 
 
 
441 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  84.03 
 
 
441 aa  665    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  100 
 
 
428 aa  854    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  82.24 
 
 
428 aa  617  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  79.44 
 
 
428 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  70.34 
 
 
438 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  61.34 
 
 
437 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  61.1 
 
 
437 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  59.29 
 
 
436 aa  500  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  59.05 
 
 
436 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  62.9 
 
 
425 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  61.41 
 
 
424 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  58.95 
 
 
436 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  60.67 
 
 
441 aa  496  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  59.86 
 
 
439 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  59.51 
 
 
441 aa  481  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  61.02 
 
 
424 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  58.61 
 
 
437 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  58.95 
 
 
436 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  58.75 
 
 
432 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  56.73 
 
 
447 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  58.85 
 
 
437 aa  473  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  58.49 
 
 
441 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  58.85 
 
 
437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  59.31 
 
 
436 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  57.18 
 
 
429 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  56.97 
 
 
443 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  57.49 
 
 
444 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  58.92 
 
 
447 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  55.66 
 
 
430 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  60.66 
 
 
446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  57.92 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  57.67 
 
 
419 aa  448  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  57.11 
 
 
447 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  56.35 
 
 
446 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  56.45 
 
 
443 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  51.49 
 
 
431 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  56.69 
 
 
443 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  53.55 
 
 
417 aa  402  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  49.02 
 
 
432 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  49.02 
 
 
432 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  49.88 
 
 
433 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  52.05 
 
 
429 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  52.05 
 
 
429 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  48.78 
 
 
432 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 
450 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  48.13 
 
 
438 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 
429 aa  302  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  41.32 
 
 
430 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  41.99 
 
 
422 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 
430 aa  300  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  39.85 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  36 
 
 
438 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  35.96 
 
 
431 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  31.29 
 
 
430 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.31 
 
 
411 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
408 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
425 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  28.5 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  27.6 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.6 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.6 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  27.6 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.6 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.95 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  28.76 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.13 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.34 
 
 
400 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.94 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  28.5 
 
 
402 aa  140  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.7 
 
 
416 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.68 
 
 
402 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.94 
 
 
402 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  27.33 
 
 
391 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  27.36 
 
 
400 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
416 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.36 
 
 
400 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  27.12 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.91 
 
 
402 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.91 
 
 
402 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  27.79 
 
 
413 aa  137  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  28.24 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  28.78 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
398 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
398 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
398 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25.99 
 
 
398 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  26.48 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.41 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  26.68 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  29.31 
 
 
401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  26.89 
 
 
412 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
421 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
407 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>