More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  100 
 
 		 436 aa  865    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 418 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  26.73 
 
 		 412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 416 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 442 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 391 aa  143  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  27.99 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 425 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  27.8 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  27.8 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  28.11 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 425 aa  136  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.82 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 424 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.57 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.82 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  27.12 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  27.36 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  27.36 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 415 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 432 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.34 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  25.42 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  25.9 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  25.24 
 
 		 412 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 418 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  25.54 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 436 aa  126  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.45 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 424 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  25.3 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  25.3 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  25.3 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  25.3 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  26.7 
 
 		 447 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  25.06 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  26.23 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  25.06 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 436 aa  123  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  25 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 407 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 443 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  26.47 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  27.36 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  30.68 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  26.23 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  26.23 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.28 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 400 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  26.23 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  26.23 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  26.23 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>