More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1033 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  97.44 
 
 
429 aa  823    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  100 
 
 
430 aa  843    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  99.77 
 
 
430 aa  842    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  60.3 
 
 
422 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4542  major facilitator transporter  64.16 
 
 
421 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.554547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  47.3 
 
 
437 aa  344  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
437 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1248  major facilitator transporter  43.7 
 
 
436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.211018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  45.37 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  44.69 
 
 
432 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  44.5 
 
 
431 aa  335  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 
436 aa  334  1e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
436 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 
436 aa  332  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  45.1 
 
 
436 aa  332  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  45.3 
 
 
424 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 
424 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  42.54 
 
 
437 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  44.9 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  42.65 
 
 
429 aa  326  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  42.44 
 
 
437 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  42.79 
 
 
429 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  42.79 
 
 
429 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 
437 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5950  major facilitator transporter  42.79 
 
 
433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  43.78 
 
 
438 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4653  major facilitator transporter  43.67 
 
 
439 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  43.07 
 
 
430 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1906  major facilitator superfamily MFS_1  41.56 
 
 
432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0108  major facilitator superfamily MFS_1  43.7 
 
 
419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2227  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374569  normal  0.368601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1951  major facilitator transporter  40.83 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4369  major facilitator superfamily transporter  43.67 
 
 
441 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.70357  normal  0.783819 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
450 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1150  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 
441 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3098  putative oxalate/formate antiporter  43.21 
 
 
438 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  40.44 
 
 
447 aa  289  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1371  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 
441 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53264  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1211  major facilitator transporter  43.21 
 
 
441 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729661  normal  0.434352 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3800  major facilitator transporter  44.58 
 
 
446 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5586  major facilitator transporter  41.32 
 
 
428 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.88616  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4656  major facilitator transporter  39.53 
 
 
443 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4698  major facilitator transporter  40.41 
 
 
446 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.0224266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2262  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  41.28 
 
 
447 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0179923  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4665  major facilitator transporter  38.57 
 
 
444 aa  270  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6027  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 
447 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.246055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3621  major facilitator transporter  40.15 
 
 
439 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387531  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0879  major facilitator transporter  42.47 
 
 
428 aa  263  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.394095  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2758  major facilitator superfamily (MFS) oxalate/formate antiporter  39.44 
 
 
443 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6739  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 
443 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.886987 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1366  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 
428 aa  256  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0674  major facilitator transporter  39.61 
 
 
417 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  35.26 
 
 
431 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  34.39 
 
 
438 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
408 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  32.38 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  30.49 
 
 
418 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
416 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  26.25 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
415 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
425 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  27.86 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  27.32 
 
 
402 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  28.15 
 
 
412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  31.24 
 
 
442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.85 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  27.05 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  27.05 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  27.05 
 
 
400 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  28.12 
 
 
418 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  27.05 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  26.42 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
405 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.78 
 
 
402 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  26.78 
 
 
402 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  26.78 
 
 
402 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.82 
 
 
402 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  29.56 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  30.43 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  29.56 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.78 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
407 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  27.64 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  30.2 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25 
 
 
436 aa  129  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1895  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
416 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  28.93 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  28.12 
 
 
412 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.62 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2503  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
436 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1924  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.37 
 
 
402 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
433 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.94 
 
 
402 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  26.37 
 
 
402 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>