More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05082 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  804    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  42.4 
 
 
410 aa  336  5e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  40.93 
 
 
412 aa  329  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  39.02 
 
 
412 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  40.69 
 
 
410 aa  318  9e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 
425 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  34.77 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 
415 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
421 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  35.69 
 
 
442 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
421 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
434 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 
465 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  32.99 
 
 
455 aa  206  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  30.22 
 
 
454 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  29.26 
 
 
397 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  32.19 
 
 
391 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  29.04 
 
 
402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  29.17 
 
 
402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  29.55 
 
 
402 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.54 
 
 
402 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.54 
 
 
402 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 
407 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  29.04 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  29.4 
 
 
408 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  30.93 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
407 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  29.04 
 
 
402 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  27.52 
 
 
402 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.31 
 
 
412 aa  150  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  28.64 
 
 
402 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  28.03 
 
 
402 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
416 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  28.68 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
405 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.46 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  27.39 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  25.99 
 
 
400 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  27.25 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
402 aa  136  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  27.53 
 
 
400 aa  136  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  25.38 
 
 
401 aa  136  8e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.53 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  27.53 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  27.79 
 
 
400 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  27.53 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  25.06 
 
 
412 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  27.34 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  29.02 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  27.34 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  27.96 
 
 
400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  27.34 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
405 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  27.96 
 
 
400 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  27.27 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.27 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.27 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  27.27 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.27 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  25.88 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  29.47 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 
433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  28.73 
 
 
406 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  25.62 
 
 
411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  27.87 
 
 
414 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  27.6 
 
 
414 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  27.6 
 
 
414 aa  126  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0056  major facilitator transporter  27.6 
 
 
414 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00977888  hitchhiker  0.000481777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
414 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  28.23 
 
 
437 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0058  major facilitator transporter  27.32 
 
 
414 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000719685  decreased coverage  0.000000078318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1372  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
436 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686349  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
437 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1212  major facilitator transporter  28.08 
 
 
432 aa  123  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.260069  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  27.39 
 
 
419 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1151  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
441 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.28 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
411 aa  120  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  27.39 
 
 
438 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
424 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2856  Oxalate/Formate Antiporter  28.49 
 
 
430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0094861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  27.3 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000134244  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 
436 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  25.73 
 
 
436 aa  113  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 
436 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.05 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2792  major facilitator transporter  26.05 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40286  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  28.64 
 
 
467 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1841  major facilitator transporter  27.78 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271882  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  26.58 
 
 
436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
467 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
430 aa  110  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  25.15 
 
 
431 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26.8 
 
 
430 aa  109  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1236  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
424 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 
429 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>