More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0467 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  85.51 
 
 
421 aa  702    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
424 aa  848    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 
433 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  55.26 
 
 
424 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  47.55 
 
 
412 aa  391  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  48.87 
 
 
413 aa  387  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  46.62 
 
 
401 aa  332  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  47 
 
 
406 aa  324  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  40.84 
 
 
418 aa  316  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
538 aa  300  3e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  41.95 
 
 
411 aa  298  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  39.95 
 
 
397 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  42.33 
 
 
467 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  42.05 
 
 
475 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  36.34 
 
 
550 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  40.47 
 
 
467 aa  282  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  39.04 
 
 
424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 
471 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  41.42 
 
 
467 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
575 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 
575 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  41.22 
 
 
463 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  40.62 
 
 
537 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 
455 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  39.39 
 
 
552 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  37.5 
 
 
548 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 
546 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  38.08 
 
 
553 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 
456 aa  260  4e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
464 aa  260  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  39.17 
 
 
553 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  35.92 
 
 
549 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  38.51 
 
 
553 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 
553 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  36.08 
 
 
558 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  38.73 
 
 
553 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  37.64 
 
 
554 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  37.42 
 
 
552 aa  253  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
552 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  37.28 
 
 
549 aa  252  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  40.41 
 
 
507 aa  252  9.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  38.65 
 
 
553 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 
549 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  37.01 
 
 
552 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  38.72 
 
 
551 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  36.03 
 
 
547 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  37.2 
 
 
556 aa  246  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  36.36 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  38.59 
 
 
566 aa  242  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 
448 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  36.44 
 
 
545 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 
518 aa  240  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
545 aa  237  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  36.49 
 
 
428 aa  237  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  36.04 
 
 
556 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 
453 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 
453 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  31.38 
 
 
432 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  34.37 
 
 
419 aa  203  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  32.9 
 
 
418 aa  190  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  32.2 
 
 
421 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  40.95 
 
 
570 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
407 aa  176  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  29.81 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  29.33 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 
421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
407 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  31.52 
 
 
391 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  29.33 
 
 
402 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  30.05 
 
 
402 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  29.33 
 
 
402 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  29.4 
 
 
402 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  30.28 
 
 
442 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  29.4 
 
 
402 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  30.52 
 
 
402 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.85 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  29.4 
 
 
402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  31.28 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  29.4 
 
 
402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  29.3 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  29.06 
 
 
402 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
411 aa  163  7e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
425 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
408 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 
407 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  29.37 
 
 
410 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.07 
 
 
400 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  29.51 
 
 
400 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  29.44 
 
 
400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
415 aa  156  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
405 aa  156  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  29.3 
 
 
400 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  29.06 
 
 
400 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  29.06 
 
 
400 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>