More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0486 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  100 
 
 
410 aa  805    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  83.66 
 
 
410 aa  676    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  78.29 
 
 
412 aa  652    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  84.39 
 
 
412 aa  698    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  42.4 
 
 
404 aa  336  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
415 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  40.2 
 
 
421 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 
421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 
421 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  41.16 
 
 
442 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  37.05 
 
 
454 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 
434 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  36.54 
 
 
455 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  36.43 
 
 
465 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
416 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  30.73 
 
 
408 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  33.51 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  32.92 
 
 
419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000021703  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  30.95 
 
 
397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 
408 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  32.23 
 
 
412 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
407 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  28.39 
 
 
400 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  31.08 
 
 
391 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000443521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  27.48 
 
 
402 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
407 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  28.19 
 
 
402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  28.19 
 
 
402 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  27.48 
 
 
402 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
407 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  30.32 
 
 
418 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  28.64 
 
 
400 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  27.48 
 
 
402 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 
421 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  27.11 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.98 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  30.53 
 
 
402 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  27.61 
 
 
398 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.61 
 
 
398 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.61 
 
 
398 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.61 
 
 
398 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
398 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  29.95 
 
 
411 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.98 
 
 
402 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  30.39 
 
 
402 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  30.39 
 
 
400 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.73 
 
 
402 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  30.39 
 
 
402 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  30.13 
 
 
400 aa  150  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  30.13 
 
 
402 aa  150  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  30.13 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  27.03 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  30.13 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  30.13 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  27.11 
 
 
400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  29.9 
 
 
442 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
405 aa  147  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  27.36 
 
 
400 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  27.36 
 
 
400 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  27.36 
 
 
400 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  27.36 
 
 
400 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  27.36 
 
 
400 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  27.36 
 
 
400 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
433 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  27.11 
 
 
400 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
411 aa  142  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4793  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.716859  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0121  major facilitator transporter  27.04 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
414 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  28.8 
 
 
414 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  32.32 
 
 
432 aa  140  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  28.8 
 
 
414 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
424 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  28.53 
 
 
414 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
421 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0056  major facilitator transporter  29.08 
 
 
414 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00977888  hitchhiker  0.000481777 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  27.41 
 
 
402 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0058  major facilitator transporter  29.08 
 
 
414 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000719685  decreased coverage  0.000000078318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  26.79 
 
 
413 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  25.36 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  29.97 
 
 
404 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
436 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  25.18 
 
 
436 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  28.97 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  27.98 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  28.65 
 
 
430 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  27.98 
 
 
358 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000134244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
430 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
429 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  25.19 
 
 
436 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
430 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6143  major facilitator transporter  25.36 
 
 
437 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.645469  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  26.23 
 
 
424 aa  122  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
441 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  27.13 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  28.74 
 
 
467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>