More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2808 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
456 aa  903    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  66.02 
 
 
518 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  65.64 
 
 
464 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  63.23 
 
 
463 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  68.28 
 
 
455 aa  521  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  63.56 
 
 
464 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  60.81 
 
 
471 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  61.22 
 
 
507 aa  483  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  61.99 
 
 
448 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  55.8 
 
 
467 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  56.25 
 
 
467 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  55.88 
 
 
475 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  53.78 
 
 
467 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  52.67 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 
538 aa  396  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 
575 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 
575 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  48.63 
 
 
553 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  46.77 
 
 
549 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  48.24 
 
 
554 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 
546 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 
545 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  47.59 
 
 
547 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 
545 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  48.96 
 
 
552 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  46.59 
 
 
545 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  48.02 
 
 
551 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  48.19 
 
 
553 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 
553 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  48.86 
 
 
552 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  46.6 
 
 
553 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  46.61 
 
 
553 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  45.66 
 
 
548 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  47.72 
 
 
549 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  44.18 
 
 
550 aa  385  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  48.45 
 
 
553 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 
549 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  46.04 
 
 
545 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  47.89 
 
 
552 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  48.74 
 
 
566 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 
552 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  47.7 
 
 
537 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  46.43 
 
 
556 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  46.28 
 
 
558 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  46.19 
 
 
556 aa  356  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1386  major facilitator transporter  38.71 
 
 
570 aa  309  8e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.863121  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  43 
 
 
421 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  40.79 
 
 
412 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  38.41 
 
 
418 aa  266  8e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  38.52 
 
 
411 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  41.98 
 
 
424 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  40.94 
 
 
413 aa  259  9e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 
424 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  37.77 
 
 
424 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  38.87 
 
 
397 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  39.15 
 
 
406 aa  229  6e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  36.82 
 
 
401 aa  229  9e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  35.29 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  33.87 
 
 
442 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
453 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  32.86 
 
 
938 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
407 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  30.41 
 
 
432 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  31.85 
 
 
421 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
421 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
421 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  28.91 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 
411 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  29.66 
 
 
412 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  30.55 
 
 
438 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  27.78 
 
 
418 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32095  predicted protein  42.22 
 
 
679 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  25.78 
 
 
402 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  28.04 
 
 
436 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  25.78 
 
 
402 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.46 
 
 
402 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26 
 
 
402 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  26.11 
 
 
402 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  25.87 
 
 
402 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  27.06 
 
 
400 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
407 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  26.77 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.64 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  25.53 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  27.51 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.25 
 
 
402 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  26.25 
 
 
402 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  26.39 
 
 
400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.25 
 
 
402 aa  117  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  26.25 
 
 
402 aa  117  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  26.25 
 
 
402 aa  117  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.37 
 
 
398 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>