226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1405 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1405  putative permease  100 
 
 		 428 aa  858    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  33.11 
 
 		 433 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  36.38 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  35.97 
 
 		 413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  34.71 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 424 aa  186  7e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 456 aa  186  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  33.58 
 
 		 401 aa  183  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  33.71 
 
 		 507 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 550 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  36.25 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 575 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  32.81 
 
 		 467 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 467 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  33.11 
 
 		 475 aa  166  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 448 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  32.01 
 
 		 549 aa  163  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 411 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 538 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 548 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 549 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  31.06 
 
 		 547 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 552 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 464 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 397 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  29.36 
 
 		 558 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 552 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 556 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 553 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 545 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 553 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 546 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  29.54 
 
 		 551 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 554 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  28.81 
 
 		 553 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  26.99 
 
 		 556 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  27.7 
 
 		 552 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 566 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  24.53 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  24.53 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  24.53 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  26.29 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  26.29 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  24.8 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  26.29 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  24.74 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  26.03 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  24.8 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  26.03 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  24.8 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  26.29 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  26.03 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  24.8 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 402 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 398 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  24.53 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  25.13 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  27 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  24.8 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.12 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 402 aa  103  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  25.77 
 
 		 400 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  26.23 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  25.52 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  25.52 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2629  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  25 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1032  putative oxalate/formate antiporter  27.65 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 425 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 432 aa  96.7  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>