14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1008 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  69.19 
 
 		 586 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  69.76 
 
 		 586 aa  827    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 583 aa  1170    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  56.19 
 
 		 591 aa  621  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  23.97 
 
 		 938 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 424 aa  57  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  32.41 
 
 		 507 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2896  polysaccharide biosynthesis protein  31.93 
 
 		 482 aa  50.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  23.69 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 499 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 514 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2595  polysaccharide biosynthesis protein  22.15 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>