13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1843 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  55.2 
 
 		 586 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 591 aa  1181    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  56.19 
 
 		 583 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  55.02 
 
 		 586 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  31.15 
 
 		 938 aa  157  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  19.66 
 
 		 504 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  25.84 
 
 		 457 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  21.3 
 
 		 424 aa  47.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2595  polysaccharide biosynthesis protein  22.19 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2896  polysaccharide biosynthesis protein  32.63 
 
 		 482 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  20.21 
 
 		 501 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  19.77 
 
 		 514 aa  43.5  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>