87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3487 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 424 aa  830    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  38.92 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  35.15 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  34.71 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  31.28 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  32.79 
 
 		 488 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  31.92 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  31.92 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  32.78 
 
 		 468 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  32.59 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  30.4 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  30.4 
 
 		 488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  30.38 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  30.25 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  30.25 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  30 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  30 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  30 
 
 		 488 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  30 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  30 
 
 		 488 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  30 
 
 		 484 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  29.78 
 
 		 488 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 		 488 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  28.85 
 
 		 486 aa  136  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 507 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.36 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  22.74 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 504 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  23.49 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  21.31 
 
 		 496 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  20.43 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1008  polysaccharide biosynthesis protein  22.62 
 
 		 583 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.314622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 513 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  25.27 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 586 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 504 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1843  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 591 aa  53.9  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.12137  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 489 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  21.7 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  21.29 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  21.29 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  21.29 
 
 		 503 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  21.15 
 
 		 492 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  21.29 
 
 		 510 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  21.29 
 
 		 510 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  20.91 
 
 		 492 aa  50.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  20.91 
 
 		 492 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  21.15 
 
 		 492 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  20.91 
 
 		 492 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  20.91 
 
 		 492 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  20.91 
 
 		 492 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  20.67 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.4 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  21.88 
 
 		 516 aa  47.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  21.01 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  19.45 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  23.67 
 
 		 461 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  19.24 
 
 		 511 aa  47.4  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 507 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  20.63 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  36.11 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 418 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.06 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  29.63 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  22.25 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  22.53 
 
 		 938 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 		 489 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  22.81 
 
 		 525 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2403  O-antigen and teichoic acid export protein  27.43 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000847308  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  35.85 
 
 		 418 aa  43.5  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 427 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>