26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_B3744 on replicon NC_007349
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1024    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  51.57 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  51.68 
 
 		 522 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  52.41 
 
 		 517 aa  504  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  46.59 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  37.16 
 
 		 522 aa  318  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  31.98 
 
 		 506 aa  276  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 		 534 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  26.08 
 
 		 505 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 505 aa  133  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 501 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  23.16 
 
 		 516 aa  60.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1424  transporter, putative  21.95 
 
 		 938 aa  60.1  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2096  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 		 511 aa  58.5  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  21.51 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  21.51 
 
 		 511 aa  52  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  19.59 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 423 aa  50.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0889  polysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 		 586 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  20.66 
 
 		 497 aa  43.9  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>