14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1219 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 505 aa  990    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  77.18 
 
 		 505 aa  768    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  49.6 
 
 		 504 aa  495  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  24.95 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 517 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 514 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  26.08 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  25.54 
 
 		 519 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  21.38 
 
 		 506 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  21.2 
 
 		 522 aa  97.4  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  25.2 
 
 		 534 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  27.83 
 
 		 504 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  29.73 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.11 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>