17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3571 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 534 aa  1030    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  33.6 
 
 		 522 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  35.93 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 519 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  32.6 
 
 		 517 aa  226  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  30.57 
 
 		 525 aa  205  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  27.9 
 
 		 506 aa  198  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  24.54 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  22.43 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  24.24 
 
 		 507 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 		 501 aa  52.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 504 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  28.07 
 
 		 468 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 		 461 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>