13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0458 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1219  polysaccharide biosynthesis protein  77.18 
 
 
505 aa  768    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0458  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
505 aa  979    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.320222  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1387  polysaccharide biosynthesis protein  50.4 
 
 
504 aa  499  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  24.02 
 
 
522 aa  146  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
517 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 
514 aa  133  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  25.48 
 
 
519 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  25.44 
 
 
525 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1803  O-antigen and teichoic acid export protein  22.09 
 
 
506 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0894  hypothetical protein  20.7 
 
 
522 aa  91.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000463989  hitchhiker  0.00000186641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3571  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 
534 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.42 
 
 
504 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1820  polysaccharide biosynthesis protein  32.98 
 
 
586 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>