58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3866 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  74.33 
 
 		 488 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  85.33 
 
 		 484 aa  783    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  85.54 
 
 		 484 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  85.54 
 
 		 484 aa  785    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  85.33 
 
 		 484 aa  783    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  98.36 
 
 		 488 aa  949    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  99.59 
 
 		 488 aa  955    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  85.54 
 
 		 484 aa  785    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  91.99 
 
 		 488 aa  821    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  98.36 
 
 		 488 aa  949    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  98.16 
 
 		 488 aa  947    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 488 aa  959    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  72.16 
 
 		 492 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  74.54 
 
 		 488 aa  709    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  87.09 
 
 		 488 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  85.66 
 
 		 488 aa  795    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  85.66 
 
 		 488 aa  795    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  97.54 
 
 		 498 aa  870    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  56.67 
 
 		 486 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  35.15 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  33.54 
 
 		 478 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  35.06 
 
 		 499 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  35.06 
 
 		 499 aa  232  9e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  29.88 
 
 		 473 aa  186  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  28.67 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  27.45 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 		 509 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  28.8 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  28.88 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  21.41 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  24.23 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0645  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 533 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  23.6 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0890  polysaccharide biosynthesis protein  25.15 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.267642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  30.43 
 
 		 507 aa  54.7  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  20.46 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 519 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  20.35 
 
 		 494 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.01 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  21.1 
 
 		 507 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  27.36 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.12 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 484 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  37.1 
 
 		 454 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  35.71 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  20.87 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  31.88 
 
 		 511 aa  43.9  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  19.18 
 
 		 501 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  20.04 
 
 		 477 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  35.48 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 		 522 aa  43.5  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  20.88 
 
 		 496 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>