39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0767 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  100 
 
 
506 aa  1002    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  46.73 
 
 
501 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3440  polysaccharide biosynthesis protein, putative  35.93 
 
 
504 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0552602  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  34.48 
 
 
507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3222  polysaccharide biosynthesis protein  36.34 
 
 
504 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0507176  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  35.55 
 
 
496 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  31.39 
 
 
497 aa  216  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  23.8 
 
 
488 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  22.04 
 
 
488 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  25.5 
 
 
492 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 
488 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 
453 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 
484 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 
488 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 
484 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  25.92 
 
 
484 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
488 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
488 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 
484 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  25.92 
 
 
484 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
498 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 
488 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
488 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  21.93 
 
 
478 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
424 aa  55.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.81 
 
 
483 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  26.32 
 
 
486 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  23.12 
 
 
473 aa  51.6  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
499 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  23.46 
 
 
499 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  22.32 
 
 
486 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  23.05 
 
 
427 aa  43.9  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 
490 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>