148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0590 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 483 aa  936    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  64.73 
 
 		 483 aa  621  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  64.78 
 
 		 486 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  48.13 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  46.68 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  47.93 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  48.76 
 
 		 484 aa  428  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  47.93 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  47.93 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  46.89 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  26.48 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  26.19 
 
 		 481 aa  160  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  25.11 
 
 		 471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  25.11 
 
 		 471 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  29.12 
 
 		 477 aa  140  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  21.18 
 
 		 485 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  24.8 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  26.36 
 
 		 478 aa  120  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  23.82 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.1 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  27.75 
 
 		 424 aa  87  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  21.85 
 
 		 472 aa  85.9  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 415 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  23.74 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  20.24 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 443 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  30.56 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  21.56 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  20.62 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  18.71 
 
 		 424 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 502 aa  64.3  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  25 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  25.18 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  19.7 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.18 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  23.06 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  23.06 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  22.02 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  20.42 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  27.6 
 
 		 512 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  22.56 
 
 		 488 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  25.51 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  19.62 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  18.12 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  20.3 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  22.4 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  21.95 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  18.12 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  18.12 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  18.12 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  18.12 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  18.12 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  18.12 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  20.23 
 
 		 440 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  22.78 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  22.78 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  22.78 
 
 		 484 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 426 aa  53.9  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 484 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 		 484 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  21.91 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  23.53 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  20.43 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  22.22 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  21.33 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  21.79 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 		 497 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 488 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.21 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 		 427 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  21.26 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  19.26 
 
 		 433 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  21.67 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  21.11 
 
 		 529 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  20.88 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  18.47 
 
 		 422 aa  50.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3026  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 		 406 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>