56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1675 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 430 aa  853    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  52.55 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  36.5 
 
 		 438 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 424 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  23.29 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  25.39 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  23.34 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  23.34 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 484 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  23.77 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  23.77 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  23.77 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  23.51 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  23.51 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  23.51 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  23.51 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  22.09 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  22.98 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  19.95 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  23.51 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.31 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  19.89 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  23.37 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1033  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 412 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0437322  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  21.25 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 		 482 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.3 
 
 		 481 aa  47.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  20.99 
 
 		 431 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  19.85 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  25.3 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  19.8 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0686  putative lipopolysaccharide O-SIDE chain biosynthesis transmembrane protein  26.04 
 
 		 422 aa  43.1  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.599007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>