94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0849 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0849  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 419 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0520  polysaccharide biosynthesis family protein  37.44 
 
 		 422 aa  285  9e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2875  polysaccharide transporter  37.62 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2209  polysaccharide transporter  37.62 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0627  polysaccharide biosynthesis family protein  37.62 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0027  polysaccharide biosynthesis family protein  37.62 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0642  polysaccharide transporter  37.62 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2497  polysaccharide transporter  37.62 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.547808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0806  polysaccharide biosynthesis family protein  37.62 
 
 		 422 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1620  polysaccharide biosynthesis protein  36.14 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0681626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 		 415 aa  275  8e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4403  polysaccharide biosynthesis protein  36.05 
 
 		 417 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6729  polysaccharide biosynthesis protein  36.97 
 
 		 415 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4200  polysaccharide biosynthesis protein  36.72 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.404926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4166  polysaccharide biosynthesis protein  36.72 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507145  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3316  polysaccharide biosynthesis protein  36.72 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0788043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  34.92 
 
 		 419 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  35.19 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1820  polysaccharide biosynthesis protein  36.16 
 
 		 418 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1929  polysaccharide biosynthesis protein  30.07 
 
 		 424 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.109004  normal  0.370568 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2025  polysaccharide biosynthesis protein  34.57 
 
 		 424 aa  203  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.997214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6018  polysaccharide biosynthesis protein  33.5 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.203106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2253  lipopolysaccharide (O-antigen)exporter  33.68 
 
 		 444 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6400  polysaccharide biosynthesis protein  29.3 
 
 		 431 aa  193  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.247838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1405  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 418 aa  189  8e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000283826  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3697  polysaccharide biosynthesis protein  30.9 
 
 		 443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.258081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0699  hypothetical protein  28.03 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.786722 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2745  polysaccharide biosynthesis protein  32.31 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1197  Wzx  28.54 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1081  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 		 421 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02920  O-antigen transporter  27.11 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00862586  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  24.46 
 
 		 471 aa  126  9e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  25.37 
 
 		 475 aa  123  7e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  24.5 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0582  polysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1104  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  24.36 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2854  polysaccharide biosynthesis protein  24.94 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.444695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  24.62 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1606  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0714758  normal  0.23948 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0573  polysaccharide biosynthesis protein  21.13 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000747167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.86 
 
 		 481 aa  99.8  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  23.08 
 
 		 486 aa  99.8  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  22.83 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2419  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0814087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1412  polysaccharide biosynthesis protein  25.76 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5060  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 		 478 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12370  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  24.82 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23390  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000307585  hitchhiker  0.00805893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1369  polysaccharide biosynthesis protein  28.04 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.52788  normal  0.0165485 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  22.53 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  23.48 
 
 		 483 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2652  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0561066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1522  PST family polysaccharide transporter  22.36 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00741299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  25 
 
 		 472 aa  87.8  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 485 aa  86.3  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5222  polysaccharide biosynthesis protein  20.6 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0028  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5560  polysaccharide biosynthesis protein, putative  19.6 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5279  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0394078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5123  spore cortex biosynthesis protein  21.47 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151446  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5522  polysaccharide synthase family protein  21.47 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5676  polysaccharide biosynthesis protein  21.47 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3729  polysaccharide biosynthesis protein  22.79 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0553833 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  21.17 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3458  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  22.74 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  25.29 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 473 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  23.19 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1675  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104334  normal  0.413628 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6750  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 		 429 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3202  hypothetical protein  23.28 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.76 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2586  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2535  polysaccharide biosynthesis protein  22.95 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  23.28 
 
 		 488 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 446 aa  46.6  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.68 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  23.58 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  22.99 
 
 		 488 aa  43.9  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  25.14 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  30.56 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  20.58 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2885  polysaccharide biosynthesis protein  18.8 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.285914  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.67 
 
 		 483 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  24.46 
 
 		 486 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>