93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2748 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  82.7 
 
 		 529 aa  782    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 526 aa  1016    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  41.14 
 
 		 542 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  38.79 
 
 		 541 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  31.59 
 
 		 488 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  26.34 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  32.59 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  32.07 
 
 		 482 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 435 aa  90.5  7e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  22.31 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  28.67 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  27.15 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.59 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 511 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 488 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  20.93 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0061  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  25.53 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  28.1 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4360  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3948  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1496  PST family polysaccharide transporter  22.2 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.104259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.06 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  20.88 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  23.17 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  20.52 
 
 		 483 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  20.56 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5503  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 491 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0743746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  27.18 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 		 427 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 490 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3183  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1078  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 424 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  27.06 
 
 		 490 aa  48.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 503 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  23.52 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4093  polysaccharide biosynthesis protein  29.11 
 
 		 419 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 539 aa  47.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  28.4 
 
 		 488 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.68 
 
 		 483 aa  47  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  26.14 
 
 		 495 aa  47  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3147  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 475 aa  47  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.875944  normal  0.24442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 509 aa  47  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3618  polysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.180964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 899 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  22.41 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  32.52 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  27.69 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  21.81 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.7 
 
 		 481 aa  44.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  30.04 
 
 		 467 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  24.19 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 476 aa  44.3  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  28.12 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 		 482 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  17.9 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  28.63 
 
 		 490 aa  43.9  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3002  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 		 435 aa  43.9  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  22.39 
 
 		 488 aa  43.9  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 489 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 		 515 aa  43.5  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 486 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 		 522 aa  43.5  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5396  oligosaccharide translocase  22.11 
 
 		 473 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  19.65 
 
 		 483 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1274  polysaccharide export protein  28.02 
 
 		 399 aa  43.5  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>