44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4125 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4125  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 542 aa  1056    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  41.76 
 
 		 529 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  41.14 
 
 		 526 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0921  polysaccharide biosynthesis protein  38.37 
 
 		 541 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  28.9 
 
 		 488 aa  120  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  26.46 
 
 		 486 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 477 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  26.74 
 
 		 482 aa  90.1  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.79 
 
 		 476 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4497  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  25.59 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  23.24 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1766  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  24.18 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 482 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 483 aa  54.7  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3189  polysaccharide biosynthesis protein  22.26 
 
 		 446 aa  53.9  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.27784  hitchhiker  0.00540344 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.85 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5553  oligosaccharide translocase  22.97 
 
 		 471 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  21.43 
 
 		 490 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  23.78 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5107  oligosaccharide translocase  20.75 
 
 		 483 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5611  oligosaccharide translocase  22.25 
 
 		 470 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  29.69 
 
 		 449 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  19.87 
 
 		 476 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.48 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2983  polysaccharide biosynthesis protein  27.85 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  23.64 
 
 		 503 aa  45.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0744  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.923042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 435 aa  44.7  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  25.68 
 
 		 429 aa  44.3  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0302  maturase-related protein  19.65 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2041  polysaccharide biosynthesis protein  24.06 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0334353  normal  0.0804458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>