76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0869 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 509 aa  997    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1078  polysaccharide biosynthesis protein  35.37 
 
 		 511 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0468263  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  27.86 
 
 		 1103 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  27.76 
 
 		 1103 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  30.1 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 		 477 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2950  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 899 aa  67.4  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  19.35 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  29.36 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 		 504 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  21.61 
 
 		 482 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 		 463 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.32 
 
 		 488 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  30.22 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  21.01 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1649  polysaccharide synthase family protein  20.46 
 
 		 478 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.44301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.82 
 
 		 471 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  30.25 
 
 		 494 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  26.49 
 
 		 471 aa  50.4  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.31 
 
 		 493 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1467  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000343252  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 		 429 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  25.12 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  22.01 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  26.25 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 		 475 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1681  polysaccharide synthase family protein  20.75 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1495  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.35 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1613  polysaccharide biosynthesis protein  20.75 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.294674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2910  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 		 485 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 480 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  30.11 
 
 		 421 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.47 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.46 
 
 		 477 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1714  polysaccharide biosynthesis protein  28.14 
 
 		 483 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0396788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 		 526 aa  47  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  21.22 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  21.91 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  26.76 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  30.19 
 
 		 529 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4090  polysaccharide biosynthesis protein  28.02 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.291597  normal  0.0803273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  27.68 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  19.77 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  19.77 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 486 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  21.9 
 
 		 481 aa  45.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  25.19 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  21.51 
 
 		 506 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 		 475 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  20.82 
 
 		 506 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  25.22 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  21.37 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  21.82 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  20.82 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  20.82 
 
 		 506 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 423 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  20.9 
 
 		 486 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 492 aa  44.3  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5305  polysaccharide biosynthesis protein  32.14 
 
 		 502 aa  43.9  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  22.84 
 
 		 444 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  23.41 
 
 		 472 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  22.54 
 
 		 500 aa  43.9  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 468 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  25.38 
 
 		 517 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>