154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0508 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
505 aa  982    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  56.21 
 
 
506 aa  548  1e-155  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  48 
 
 
500 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  47.2 
 
 
500 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  25.92 
 
 
517 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  25.46 
 
 
499 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  23.23 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
539 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 
512 aa  71.6  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1761  polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 
515 aa  70.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  25.48 
 
 
510 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  29.39 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  24.4 
 
 
494 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.13 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  28.81 
 
 
517 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  24.11 
 
 
504 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 
547 aa  67.4  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  28.44 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  24.84 
 
 
510 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  29.39 
 
 
423 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  26.91 
 
 
477 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 
429 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0590  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.56 
 
 
483 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000415804  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  29.94 
 
 
427 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 
546 aa  64.3  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 
583 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1143  polysaccharide biosynthesis protein  26.64 
 
 
514 aa  60.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2225  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
495 aa  60.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00989737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 
534 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  26.42 
 
 
490 aa  60.1  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2688  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
517 aa  60.1  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  26.45 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  26.45 
 
 
506 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  26.45 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  27.34 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  26.03 
 
 
506 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  25.23 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  24.37 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  26.34 
 
 
506 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  25.23 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0598  stage V sporulation protein B  21.19 
 
 
513 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 
542 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
475 aa  59.3  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  24.37 
 
 
459 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  25.64 
 
 
506 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  26.79 
 
 
488 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 
490 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  24.6 
 
 
459 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.6 
 
 
459 aa  57.4  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  24.6 
 
 
459 aa  57.4  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 
433 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  24.6 
 
 
459 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
492 aa  57  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  24.43 
 
 
459 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  24.08 
 
 
459 aa  57  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
506 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
444 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
504 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1301  polysaccharide biosynthesis protein  22.71 
 
 
483 aa  53.9  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  29.93 
 
 
461 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
495 aa  53.9  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 
506 aa  53.9  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1307  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 
483 aa  53.9  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
535 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
505 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  21.51 
 
 
446 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  27.95 
 
 
486 aa  52.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  26.29 
 
 
360 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  23.79 
 
 
519 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  24.4 
 
 
506 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  23.36 
 
 
475 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  22.33 
 
 
459 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.58 
 
 
490 aa  52  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  21.23 
 
 
492 aa  51.6  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  22.8 
 
 
550 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  29.86 
 
 
478 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  22.38 
 
 
426 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 
483 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 
410 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.35 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  22.68 
 
 
478 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 
487 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0528  cytosol aminopeptidase  23.39 
 
 
464 aa  50.4  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 
479 aa  50.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  22.33 
 
 
550 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1862  polysaccharide efflux transporter, putative  24.16 
 
 
496 aa  49.7  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 
526 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  22.8 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  22.8 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  22.8 
 
 
550 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  22.8 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  22.33 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  26.92 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  22.8 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  22.8 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0941  polysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 
483 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>