17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0705 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 505 aa  998    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  24.58 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.86 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  20.89 
 
 		 512 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  20.08 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  27.19 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  23.31 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 478 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2684  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  23.91 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  24.71 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 500 aa  43.9  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 		 449 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.29 
 
 		 446 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>