151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1593 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
504 aa  1004    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  48.67 
 
 
492 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  41.48 
 
 
490 aa  375  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  40.12 
 
 
481 aa  333  5e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  26.27 
 
 
475 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  28.45 
 
 
479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 
480 aa  136  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  26.43 
 
 
470 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
476 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
485 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  25.8 
 
 
478 aa  99.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 
490 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  28.7 
 
 
446 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  27.03 
 
 
476 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  27.37 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  31.53 
 
 
407 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  31.12 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 
453 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
489 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  28.21 
 
 
499 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  24.38 
 
 
500 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 
489 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.82 
 
 
446 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  28.87 
 
 
474 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0253  polysaccharide biosynthesis protein  29.82 
 
 
435 aa  61.6  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000123579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
471 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.81 
 
 
461 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  22.49 
 
 
449 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0727  polysaccharide biosynthesis protein  24.55 
 
 
478 aa  60.1  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.207142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 
423 aa  60.1  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
430 aa  60.1  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.7 
 
 
488 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  27.38 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  23.26 
 
 
500 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  31.69 
 
 
463 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  26.18 
 
 
514 aa  59.7  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  20.81 
 
 
486 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.43 
 
 
444 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 
482 aa  58.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
460 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1371  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 
472 aa  57.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20.82 
 
 
430 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0050  polysaccharide biosynthesis protein  25.21 
 
 
533 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  29 
 
 
490 aa  57.4  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  26.73 
 
 
478 aa  57.4  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  29.29 
 
 
475 aa  57.4  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  27.23 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 
504 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 
458 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
506 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 
512 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
509 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  24.31 
 
 
424 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  36.25 
 
 
481 aa  55.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  22.94 
 
 
477 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
447 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0508  polysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
505 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.91 
 
 
547 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  25.34 
 
 
471 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  28.57 
 
 
467 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
501 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
451 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5256  polysaccharide synthase family protein  25.29 
 
 
533 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 
546 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  23.08 
 
 
476 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  24.77 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  25.39 
 
 
533 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 
514 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  24.74 
 
 
481 aa  52  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1353  polysaccharide biosynthesis protein  21 
 
 
486 aa  52  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 
413 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  23.86 
 
 
458 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8594  polysaccharide biosynthesis protein  23.76 
 
 
434 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  25.91 
 
 
427 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1685  polysaccharide biosynthesis protein  24.51 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.929392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  25.75 
 
 
519 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
444 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2602  polysaccharide biosynthesis protein  27.23 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
514 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  27.08 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  28 
 
 
489 aa  48.5  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  25.51 
 
 
533 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  21.59 
 
 
435 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  27.12 
 
 
456 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0054  stage V sporulation protein B  25.51 
 
 
533 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  25.51 
 
 
533 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0054  stage V sporulation protein B  25.51 
 
 
533 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 
456 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  27.01 
 
 
423 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  23.15 
 
 
529 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0053  stage V sporulation protein B, putative  24.64 
 
 
533 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.04 
 
 
459 aa  47.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.143417 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>